La Secretaría de Control Judicial depende de la Suprema Corte de Justicia a través de su Presidente, y tiene las siguientes funciones (art. 1º, Acuerdo Nº 3131)


a) Intervenir en el control disciplinario de magistrados, funcionarios y empleados.
b) Implementar las actividades de control de gestión que el Tribunal disponga, contando para ello con la colaboración de otras áreas de la Suprema Corte, en función de las instrucciones recibidas del Tribunal o su Presidente.
c) Propender a la resolución de conflictos que se susciten entre los integrantes del Poder Judicial.